多项最新成果集中亮相ACS,深势科技药研解决方案引海外关注|ACS Spring 2025
在刚刚落下帷幕的美国化学会春季年会(ACS Spring 2025)大会上,深势科技全面展示了在药物计算设计领域的研发进展和最新成果,吸引了来自全球学术界和产业界的广泛关注。
ACS Spring 2025
大会概况
美国化学会春季年会(ACS Spring 2025)于近日在美国加利福尼亚州圣地亚哥顺利召开,作为化学领域全球最具影响力的学术会议之一,本次会议汇聚了近15,000名来自全球的科研工作者与产业界专家,共同探讨化学领域的前沿进展。ACS Spring 2025 为参会者提供了最新科研动态的交流平台,同时也为跨界合作搭建了坚实桥梁。
深势科技在本次会议上开展了6场口头报告和1个墙报展示,集中亮相了深势科技在药物计算设计领域从算法研发到应用实践的最新成果。深势科技还在大会现场设立了展台,全面展示了深势科技 Hermite® 药物计算设计平台和 RiDYMO® 高质量 Hit 发现平台的综合能力。
报告和墙报
精彩回顾
在 ACS Spring 2025 大会上,深势科技药物计算设计最新成果集中亮相,6场报告和1个墙报全面展示了深势科技基于 AI for Science 研发范式推出的最新算法成果和在实际药物研发中的落地应用,体现了深势科技在药物计算设计领域的国际领先地位。
1. 高精度结合自由能计算工具 Uni-FEP:算法先进、充分验证
深势科技推出的 Uni-FEP 自由能计算工具在 JACS 2015 和 JCIM 2020 体系测试中,计算结果与 Schrödinger FEP+ 2023年公布的最新表现相当。为进一步验证 Uni-FEP 在更多蛋白靶点和分子转换场景下的稳定性和精度,深势科技推出了 Uni-FEP-Benchmarks 项目,在150个蛋白-配体体系、超过2,100个独特分子结构上对 Uni-FEP 进行了验证,是目前全球最大的自由能计算公开数据集,在 ACS Spring 2025 获得大量关注和讨论。
Uni-FEP-Benchmarks 已在 Github 上以 Apache 2.0 协议开源
https://github.com/dptech-corp/Uni-FEP-Benchmarks。
2. 全新分子对接引擎 Uni-Dock v2:超高性能、高度灵活
深势科技最新分子对接引擎 Uni-Dock v2 在 ACS Spring 2025 首次亮相!在继承了前作超高对接速度的基础上,Uni-Dock v2 在架构设计上实现了高度灵活,可以构建如构象采样、局部搜索及构象优化等功能,提升了对接策略的多样性。新增的特性能轻松设置 constrains、restrains 等约束条件,还支持使用分子力场作为自定义打分函数,从而为多场景分子对接提供了更为强大且原生的解决方案。
Uni-Dock v2 已在 Github 上以 Apache 2.0 协议开源
https://github.com/dptech-corp/Uni-Dock2。
3. ADC 药物计算设计领先实践:计算驱动的 payload-linker 设计
深势科技在 ADC 药物计算设计领域的实践在 ACS Spring 2025 获得大量关注。在载荷 Payload 的设计与优化方面,深势科技借助自研的 Uni-QSAR 模块,通过预训练-微调的(Pretrain-finetune)方式,仅用约20个含喜树碱骨架的分子构建了接近实验精度的乳腺癌耐药蛋白(BCRP)外排特性预测;在 Linker 连接子等的设计方面,借助分子力学及量子化学手段,对 ADC 药物的安全有效释放及聚集问题进行了精细且完整的评估流程构建,从而更好地服务于工业级药物研发项目需求。
喜树碱类化合物经 BCRP 介导的细胞外排性质预测工具已经上线 Bohrium APP 平台
https://bohrium.dp.tech/apps/efflux-predictor。
除此之外,深势科技还与合作者分享了:
高效、高精度解离常数预测模型 Uni-pKa
https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jacsau.4c00271
可用于虚拟筛选和反向钓靶的蛋白-分子多模态对比学习模型 Uni-Clip
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.22.609123v2.abstract
可用于共价配体等复杂结构拆分的复合物结构解析方法 LigandExplorer
https://bohrium.dp.tech/apps/ligandexplorer
还以墙报展示形式分享了基于大原子模型 DPA-2 的力场优化策略
https://arxiv.org/abs/2406.09817。
展台与现场互动
除了精彩的口头报告,深势科技还在 ACS Spring 2025 会议展区设立了展台,以"Democratizing Computational Drug Design"为主旨,通过实时演示和详细解说,全面展示了深势科技药物计算设计平台 Hermite® 和高质量 Hit 发现平台 RiDYMO® 的综合能力,展台吸引了众多学界和业界研究者的关注。作为深势科技在海外的服务商,Atombeat 团队联袂出席了本次活动。
深势科技在 ACS Spring 2025 的展台
来自某国际知名药企的 CADD 负责人在展台详细了解了 Uni-FEP。他表示企业中每年都会开展大量的 FEP 计算以进行不同化学修饰下的先导化合物评估。Uni-FEP 测试充分、表现优秀,给他在自由能计算工具提供了新的选择。另外,他还充分赞扬了搭载 Uni-FEP 的 Hermite® 药物计算设计平台用户友好的交互设计,直观的操作逻辑、好看的界面设计和详细的结果分析对提升研发效率很有帮助。他表示不仅会在自己企业中推动 Uni-FEP 的试用,还会把这款产品推荐给他在药物初创公司的朋友。
来自某生物技术公司的研发人员在听完深势科技 ADC 药物计算设计领先实践报告后,前来展台进一步交流,深入了解深势科技在药物发现整体解决方案中的多维布局。深势科技介绍了 RiDYMO® 高质量 Hit 发现和优化平台的综合能力,展示了包括 c-Myc、GPX4 的小分子发现,以及环肽和 ADC 等其他形式药物研发项目的成功案例。他对深势科技药物计算设计服务能力表现出浓厚兴趣,探讨了实质的合作机遇。
还有 Uni-Dock 的用户专程前来展台与我们见面,分享了其在研究项目中使用基于 Uni-Dock 构建了自己的虚拟筛选工作流程完成了上亿分子的筛选评估工作。她对深势科技的开源精神表示了赞赏和感谢,并详细了解了 Uni-Dock v2 的全新特性和更新计划,表示将持续关注深势科技的研发进展。
结语
通过本次 ACS Spring 2025 会议,深势科技不仅验证了先进药物计算设计方法在全球药物研发中的广泛应用,更成功展现了深势科技在药物计算设计算法、平台和服务领域的国际领先实力,同时与众多企业和学术机构建立了合作意向。展望未来,深势科技将继续秉持 AI for Science 技术创新理念,不断提升产品性能,推动全球协作,致力于引领计算药物设计领域的持续进步,为全球药物研发提供更多高效、智能的解决方案。
深势科技与伙伴们在 ACS Spring 2025 的合影